Perbezaan utama antara baja dan bahan organik adalah bahawa baja adalah bentuk bahan organik yang buatan manusia sementara bahan organik adalah sebatian kaya karbon yang terbentuk secara semula jadi di dalam tanah.
Tumbuhan adalah pengeluar utama utama dalam ekosistem kita. Oleh itu, mereka penting untuk membekalkan makanan untuk haiwan lain dan juga turut serta dalam menjaga keseimbangan semula jadi. Tumbuhan juga memerlukan makanan dan air untuk tumbuh. Mereka bergantung pada tanah untuk makanan, air dan habitat. Oleh itu, tanah perlu berada dalam keadaan sihat, dan bahan organik diperlukan untuk menjaga kualiti tanah. Bahan organik adalah sebatian yang mengandungi karbon. Di dalam tanah, terdapat banyak bentuk bahan organik. Sebaliknya, Manure adalah buatan manusia dan mengandungi semua nutrien penting yang diperlukan untuk peningkatan kesihatan tanah. Oleh itu, bahan organik dan baja adalah dua istilah yang sangat penting dalam biologi tanah dan pertanian.