Perbezaan utama antara ekspresi gen dan peraturan gen adalah bahawa ekspresi gen adalah proses yang menghasilkan protein fungsional atau RNA dari maklumat genetik yang tersembunyi dalam gen sementara peraturan gen adalah proses yang mendorong atau menekan ekspresi gen.
Gen adalah serpihan DNA tertentu yang terletak di kromosom. Ia terdiri daripada intron, yang merupakan urutan bukan pengekodan, dan ekson, yang merupakan urutan pengekodan. Gen mengalami ekspresi melalui dua langkah utama untuk menghasilkan protein. Urutan khusus nukleotida menentukan protein yang dihasilkan. Oleh itu, sangat mustahak untuk mengekspresikan dan mengatur gen untuk mencegah pengeluaran protein yang tidak diperlukan yang boleh menyebabkan pelbagai masalah termasuk gangguan genetik, sindrom, dan lain-lain. Oleh itu, ekspresi gen dan pengawalan gen adalah dua proses yang sangat penting yang berlaku dalam organisma hidup. Walau bagaimanapun, kedua-dua proses ini berlaku secara berasingan; kedua-dua proses berlaku serentak.
