Perbezaan utama antara muon dan meson adalah bahawa muon adalah sejenis zarah unsur yang tidak mempunyai substruktur sedangkan meson adalah sejenis zarah subatomik hadron yang mempunyai sepasang partikel quark dan anti-quark.
Muon dan meson adalah dua jenis zarah dalam jirim. Muon adalah sejenis zarah unsur seperti elektron, dan kita tidak dapat membahagikannya lebih jauh ke dalam struktur yang lebih kecil (seperti quark). Tetapi meson agak lebih besar daripada muon dan mengandungi zarah quark dan antiquark; oleh itu, mereka berada di bawah kategori yang berbeza yang disebut partikel subatomik hadron. Istilah hadron menunjukkan bahawa ia mengandungi dua atau lebih zarah quark, dan zarah subatomik adalah struktur yang lebih kecil daripada tom, yang membina struktur atom.
