Perbezaan utama antara fagositosis dan opsonisasi adalah bahawa fagositosis adalah mekanisme yang dilaksanakan oleh sel atau organisma tertentu untuk menelan atau menyelubungi zarah asing sementara opsonisasi adalah proses di mana patogen dikeluarkan dari sistem setelah ditandai dengan cara opsonin.
Tindak balas imunologi boleh bersifat semula jadi atau adaptif. Patogen mempunyai reseptor pengenalan patogen yang menjadikannya lebih mudah dikenali oleh inang. Opsonisasi dan fagositosis adalah dua tindak balas imunologi. Dalam opsonization, host mengenal pasti dan menandakan zarah menyerang untuk dimusnahkan oleh pengeluaran opsonin. Fagositosis adalah mekanisme di mana sel-sel kekebalan tertentu menyelubungi dan memusnahkan zarah-zarah menyerang atau zarah asing dari badan.
