Perbezaan utama antara opsonisasi dan peneutralan bergantung pada cara mereka melakukan tindak balas imunologi. Dalam opsonisasi, patogen ditandakan sebelum dimusnahkan sementara semasa peneutralan, kesan patogen dinetralkan.
Tindak balas imunologi boleh bersifat semula jadi atau adaptif. Patogen mempunyai reseptor pengenalan patogen, yang menjadikannya lebih mudah dikenali oleh inang. Dalam opsonization, tuan rumah menghasilkan opsonin. Walau bagaimanapun, dalam peneutralan, inang menghasilkan antibodi peneutralan untuk meneutralkan kesan tindak balas antibodi-antigen.
