Perbezaan utama antara plasmid F dan plasmid R adalah bahawa plasmid F adalah DNA ekstrakromosom yang mengandungi gen yang mengekodkan faktor kesuburan. Sementara itu, R plasmid adalah DNA ekstrakromosom yang mengandungi gen yang mengekodkan ketahanan terhadap antibiotik.
Plasmid adalah DNA untai berkembar kecil yang terdapat dalam bakteria. Mereka adalah DNA ekstrakromosom dan mampu meniru diri. Mereka membawa gen yang diperlukan untuk replikasi dan pemeliharaan diri mereka sendiri. Selain mengandungi gen yang diperlukan untuk replikasi diri, plasmid juga mengandungi beberapa gen lain yang diperlukan untuk pengekodan ciri khas, seperti ketahanan terhadap antibiotik, degradasi makromolekul, toleransi logam berat, penghasilan bakteriosin, pemindahan gen, dan lain-lain, yang bermanfaat untuk bakteria.
Lebih-lebih lagi, terdapat pelbagai jenis plasmid. Plasmid R dan plasmid F adalah dua jenis antaranya. F plasmid adalah plasmid kesuburan yang mampu melakukan konjugasi dan penghasilan pili seks. R plasmid adalah plasmid rintangan yang mampu memberikan ketahanan terhadap antibiotik dan perencat pertumbuhan bakteria tertentu.