Perbezaan utama antara alpha dan beta anomer adalah bahawa dalam alpha anomer kumpulan hidroksil pada karbon anomer adalah cis kepada eksosiklik oksigen di pusat anomerik, sedangkan dalam beta anomer kumpulan hidroksil adalah trans ke oksigen eksosiklik.
Anomer adalah variasi geometri di antara karbohidrat. Ini adalah sejenis epimer di mana kita dapat melihat atom karbon anomerik. Atom karbon anomer berasal dari karbonil karbon struktur rantai terbuka karbohidrat. Oleh itu, pembentukan struktur siklik dari struktur rantai terbuka disebut anomerisasi.
