Perbezaan utama antara pemilihan menstabilkan dan menyeimbangkan adalah bahawa pemilihan menstabilkan adalah jenis pemilihan semula jadi yang menyukai fenotip rata-rata dalam populasi sementara pemilihan keseimbangan adalah pemeliharaan pelbagai alel gen dalam populasi untuk meningkatkan kepelbagaian genetik.
Menstabilkan pemilihan adalah sejenis pemilihan semula jadi yang berlaku pada sifat fenotipik. Ini menyukai fenotip rata-rata dalam populasi. Oleh itu, ia menghilangkan kedua-dua jenis fenotip ekstrem. Pada akhirnya menjadikan populasi seragam. Mengimbangi pemilihan adalah beberapa proses selektif yang mengekalkan kepelbagaian genetik dalam populasi dengan mengekalkan pelbagai alel gen. Oleh itu, ia berlaku untuk lokus gen.