Perbezaan utama antara kesan resonans dan mesomer adalah bahawa resonans adalah hasil interaksi antara pasangan elektron tunggal dan pasangan elektron ikatan sedangkan kesan mesomerik berlaku kerana adanya kumpulan pengganti atau kumpulan berfungsi.
Dua konsep kimia kesan resonans dan mesomerik menentukan struktur kimia tepat molekul organik. Resonans timbul dalam molekul yang mempunyai pasangan elektron tunggal pada mana-mana atom dalam molekul. Kesan mesomer timbul jika molekul mempunyai substituen atau kumpulan berfungsi. Kedua-dua fenomena ini biasa terdapat pada molekul organik.