Perbezaan utama antara pernafasan dalaman dan luaran adalah bahawa pernafasan dalaman merujuk kepada sekumpulan reaksi metabolik yang berlaku di dalam sel untuk menghasilkan tenaga melalui pengoksidaan glukosa dan molekul organik lain sementara pernafasan luaran merujuk kepada proses memindahkan oksigen dari persekitaran luaran ke sel dan memindahkan karbon dioksida dari badan ke persekitaran luaran.
Apabila anda mendengar istilah pernafasan, mungkin mengingatkan anda proses yang disebut pernafasan. Itulah proses menyedut dan menghembus udara. Namun, selain daripada proses ini, terdapat proses pernafasan lain yang berlaku di dalam sel-sel organisma. Ia adalah proses yang disebut respirasi selular. Oleh itu, kedua proses ini, pernafasan dan pernafasan sel, masing-masing disebut sebagai pernafasan luaran dan pernafasan dalaman. Terdapat perbezaan antara pernafasan dalaman dan luaran dalam banyak aspek. Walaupun begitu, pernafasan dalaman dan luaran saling berkaitan kerana pernafasan dalaman menggunakan oksigen yang keluar melalui pernafasan luaran, dan pernafasan luaran menghilangkan karbon dioksida; produk sampingan pernafasan dalaman.
