Perbezaan utama antara genom dan kumpulan gen adalah bahawa genom merujuk kepada keseluruhan DNA organisma sementara kumpulan gen merujuk kepada set lengkap gen unik dari populasi pembiakan.
Gene adalah unit struktur asas keturunan. Gen berpindah dari ibu bapa ke keturunan melalui gamet. Juga, mereka terdapat dalam genom organisma. Genom adalah set lengkap DNA organisma. Kumpulan gen juga merupakan istilah yang serupa. Tetapi, ia menggambarkan pengumpulan semua gen yang terdapat dalam populasi atau spesies. Berbeza dengan genom, kumpulan gen adalah campuran gen populasi. Oleh itu, kumpulan gen mewakili semua alel yang mungkin terdapat pada populasi tertentu.