Perbezaan utama antara transformasi dan transduksi adalah bahawa transformasi adalah mekanisme yang mengubah bahan genetik bakteria dengan pengambilan langsung bahan genetik eksogen dari persekitarannya melalui membran sel dan memasukkannya ke dalam genom sementara transduksi adalah suntikan DNA asing oleh virus bacteriophage ke dalam bakteria inang.
Konjugasi adalah kaedah pengumpulan semula DNA yang terkenal, yang boleh didapati di eukariota dan prokariota. Para saintis telah menemui bahawa mungkin untuk memindahkan DNA dari satu sel bakteria ke sel lain dengan dua mekanisme lain: transformasi dan transduksi. Sama dengan konjugasi, kedua mekanisme ini memindahkan DNA dalam satu arah, dan penggabungan semula berlaku di antara alel di kawasan DNA homolog. Kedua-dua mekanisme memindahkan sejumlah kecil DNA dan tidak memindahkan keseluruhan kromosom sel.
