Perbezaan utama antara perencat transkripase terbalik nukleosida dan nukleotida adalah bahawa perencat transkripase terbalik nukleosida harus difosforilasi oleh kinase sel inang sementara perencat transkripase terbalik nukleotida tidak perlu menjalani fosforilasi awal.
Transkripase terbalik adalah enzim yang mengubah molekul RNA menjadi ssDNA. HIV dan retrovirus mempunyai enzim ini untuk mensintesis ssDNA dari genom RNA mereka di dalam sel inang. Oleh itu, adalah mungkin untuk mencegah jangkitan HIV dan retrovirus lain dengan menghalang aktiviti enzim transkripase terbalik, sehingga mencegah sintesis genom virus dan pendaraban virus. Inhibitor transkripase terbalik adalah kelas ubat antiretroviral yang digunakan untuk merawat jangkitan virus seperti ini. Ubat-ubatan ini mensasarkan enzim transkripase terbalik dan mencegah tindakan pemangkinnya, menyekat sintesis DNA dari RNA virus. Inhibitor transkripase terbalik nukleosida dan nukleotida adalah dua jenis ubat. Inhibitor ini sangat penting, terutamanya dalam rawatan AIDS.