Perbezaan utama antara fenetik dan kladistik adalah kaedah yang digunakan dalam mengklasifikasikan organisma. Fenetik mengklasifikasikan organisma berdasarkan ciri morfologi dan struktur sementara cladistik mengklasifikasikan organisma berdasarkan keturunan dan hubungan evolusi mereka.
Klasifikasi organisma adalah proses penting dalam biodiversiti dan kajian biologi. Taksonomi memudahkan pengkelasan pelbagai sistem sambil membantu dalam pengelompokan dan pengelompokan organisma. Dalam hal ini, fenetik dan kladistik memainkan peranan penting dalam membina hubungan antara organisma.