Perbezaan utama antara dynein dan kinesin adalah bahawa dynein adalah protein motor sitoskeleton yang bergerak ke arah hujung minotubulus manakala kinesin adalah protein motor sitoskeleton lain yang bergerak ke arah akhir mikrotubulus.
Sitoskeleton terdiri daripada pelbagai jenis filamen. Microtubules adalah satu jenis di antaranya. Mereka memandu pergerakan bahan di dalam sel. Mereka juga penting dalam menjaga bentuk sel. Selain itu, mikrotubulus sangat penting dalam memisahkan kromosom dalam mitosis dan meiosis. Selanjutnya, mikrotubulus adalah komponen utama silia dan flagela dari beberapa sel eukariotik. Secara struktural, mikrotubulus adalah struktur kutub. Mereka mempunyai akhir positif dan akhir minus. Secara amnya, hujung tolak memanjang ke arah pusat sel sementara hujung tambah memanjang ke arah permukaan sel. Semasa pengangkutan intraselular vesikel dan organel, dua jenis protein motor sitoskeleton membantu mikrotubulus. Mereka adalah dyneins dan kinesins. Dyneins bergerak ke arah hujung minus mikrotubulus sambil membawa bahan ke pusat sel. Sebaliknya, kinesin bergerak ke arah permukaan sel membawa bahan ke pinggiran sel.