Perbezaan utama antara struktur homolog dan struktur vestigial adalah bahawa struktur homolog adalah struktur yang serupa secara anatomi yang terdapat dalam organisma yang berbeza yang mempunyai nenek moyang yang sama sedangkan struktur vestigial adalah struktur anatomi yang telah kehilangan kegunaannya terhadap organisma.
Struktur homolog adalah struktur vestigial adalah dua jenis struktur anatomi yang penting evolusi. Struktur homolog adalah struktur serupa yang terdapat dalam organisma berbeza yang berasal dari nenek moyang bersama. Sebaliknya, struktur vestigial adalah struktur yang tidak lagi berguna untuk organisma dan mempunyai ukuran yang lebih kecil.
