Perbezaan utama antara kembar embrio buatan dan pemindahan nuklear sel somatik adalah bahawa kembar embrio tiruan adalah teknik di mana pemisahan telur yang disenyawakan menjadi dua embrio yang sama secara genetik berlaku dalam keadaan in vitro sementara pemindahan nuklear sel somatik adalah teknik di mana penyisipan nukleus sel somatik ke dalam sel telur yang berintuk berlaku dalam keadaan in vitro.
Pengklonan molekul adalah teknik penting dalam menghasilkan organisma rekombinan dengan watak yang lebih baik. Pengembalian embrio buatan dan pemindahan nuklear sel somatik adalah dua teknik yang digunakan dalam keadaan in vitro untuk tujuan membuat klon untuk tujuan pembiakan dan terapi. Walau bagaimanapun, terdapat perbezaan antara kembar embrio buatan dan pemindahan nuklear sel somatik dari segi kaedah pengklonan mereka.