Perbezaan utama antara penghalang otak darah dan penghalang CSF darah adalah bahawa penghalang otak darah adalah penghalang yang memisahkan tisu darah dan tisu otak sementara penghalang CSF darah adalah penghalang fungsional yang memisahkan tisu darah dan cairan serebrospinal.
Penghalang otak darah dan penghalang CSF darah adalah dua penghalang pelindung di otak. Juga, mereka penting dalam mengangkut molekul ke otak dan tisu darah periferal. Selain itu, kedua-dua penghalang mempunyai persimpangan yang ketat yang memudahkan pemindahan sebatian tidak toksik ke otak.
