Perbezaan Utama - Urutan Mikro vs Penjujukan Generasi Seterusnya
Proses penjujukan DNA digunakan secara meluas dalam bidang bioteknologi, virologi, diagnosis perubatan dan sains forensik. Ini adalah proses yang menentukan urutan tepat nukleotida, adenin, guanin, timin dan sitosin yang terdapat dalam molekul DNA. Prosedur penjujukan DNA telah menjadi pemacu penemuan ajaib dalam penyelidikan perubatan dan biologi. Kaedah penjujukan ini telah berkembang hingga menjujukan genom lengkap organisma individu termasuk manusia dan spesies hidup lain. Microarrays dan Next Generation Sequencing adalah prosedur penjujukan DNA moden. Teknik microarray secara khusus berdasarkan hibridisasi yang mengandungi satu set sasaran yang diketahui. Penjujukan generasi seterusnya didasarkan pada sintesis (yang menggunakan DNA polimerase untuk memasukkan nukleotida) dan mempunyai keupayaan untuk menguraikan keseluruhan genom yang tidak bergantung pada sasaran yang dipilih sebelumnya. Ini adalah perbezaan utama antara Urutan Mikro dan Penjujukan Generasi Seterusnya.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Microarray
3. Apakah Penjujukan Generasi Seterusnya
4. Persamaan Antara Urutan Mikroarray dan Generasi Seterusnya
5. Perbandingan Berdampingan - Mikroarray vs Urutan Generasi Seterusnya dalam Jadual Jadual
6. Ringkasan
Apa itu Microarray?
DNA microarray digunakan sebagai alat makmal untuk mengenal pasti ribuan ekspresi gen yang berbeza pada masa yang sama. Ini adalah permukaan padat, iaitu slaid mikroskop, yang berisi koleksi bintik-bintik DNA mikroskopik yang dicetak di atasnya. Setiap tempat bercetak mengandungi urutan gen atau gen yang diketahui. Probe yang diketahui yang dicetak pada slaid berfungsi sebagai probe untuk mengesan ekspresi gen. Ini dikenali sebagai transkripome. Hibridisasi antara dua helai DNA adalah asas utama berdasarkan mikroarray. Ini adalah pasangan asas pelengkap urutan asid nukleik dengan pembentukan ikatan hidrogen.
Gambar 01: Microarray
Pada mulanya, molekul mRNA dikumpulkan dari sampel eksperimen dan sampel rujukan yang diperoleh daripada individu yang sihat. Sampel eksperimen diperoleh daripada individu yang berpenyakit; sebagai contoh, individu yang menderita barah. Setelah diperoleh, kedua-dua sampel mRNA diubah menjadi cDNA (DNA pelengkap). Seterusnya, setiap sampel dilabel menggunakan probe pendarfluor. Probe pendarfluor berbeza warna untuk membezakan cDNA sampel dari cDNA rujukan. Untuk memulakan pengikatan molekul cDNA ke slaid mikroarray, kedua sampel dicampurkan bersama. Hibridisasi adalah proses di mana molekul cDNA melekat pada probe DNA pada slaid mikroarray. Setelah hibridisasi selesai,satu siri tindak balas berlaku untuk mengenal pasti dan mengukur ekspresi setiap gen dengan penampilan warna yang berbeza mengikut jumlah gen yang dinyatakan. Hasil dari microarray digunakan dalam pembuatan profil ekspresi gen yang dapat digunakan untuk mengenal pasti keadaan penyakit yang berbeza.
Apakah Penjujukan Generasi Seterusnya?
Penjujukan Generasi Seterusnya (NGS) adalah kaedah penjujukan genetik yang maju. Prinsipnya serupa dengan Sanger Sequencing, yang bergantung pada elektroforesis kapilari. Di NGS, helai genom dipecah dan dihubungkan ke helai templat. Asas setiap helai dikenal pasti oleh isyarat yang dipancarkan semasa proses ligasinya. Dalam kaedah penjujukan Sanger, tiga langkah terpisah, penjujukan, pemisahan, dan pengesanan terlibat. Oleh kerana langkah-langkah yang berasingan ini, automasi penyediaan sampel terhad dalam throughput. Di NGS, teknik ini dikembangkan dengan menggunakan urutan berdasarkan larik dengan kombinasi langkah-langkah prosedur penjujukan Sanger yang dapat menyebabkan berjuta-juta siri reaksi dilakukan secara selari pada masa yang sama; ini menghasilkan kelajuan tinggi dan throughput dengan kos yang rendah.
Gambar 02: Perkembangan di NGS
NGS terdiri daripada tiga langkah; persiapan perpustakaan (penciptaan perpustakaan dengan penggunaan fragmentasi DNA secara rawak), penguatan (penguatan perpustakaan menggunakan penguat klonal dan PCR) dan penjujukan. Proses penjujukan genom yang dilakukan untuk jangka masa yang sangat lama menggunakan prosedur penjujukan Sanger dapat diselesaikan dalam beberapa jam menggunakan NGS.
Apakah Kesamaan Antara Jujukan Mikroarray dan Generasi Seterusnya?
Kedua-dua Urutan Microarray dan Generasi Seterusnya dikembangkan menggunakan penjujukan berdasarkan array
Apakah Perbezaan Antara Urutan Microarray dan Generasi Seterusnya?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Urutan mikro vs Penjujukan Generasi Seterusnya |
|
| Microarray adalah kumpulan bintik DNA mikroskopik yang melekat pada permukaan padat, yang digunakan untuk mengukur tahap ekspresi sejumlah besar gen secara serentak. | NGS (Penjujukan generasi seterusnya) adalah teknologi penjujukan DNA berkelajuan tinggi bukan berasaskan Sanger yang memudahkan berjuta-juta atau berbilion helai DNA diuruskan secara selari. |
| Interaksi dengan Antigen | |
| Microarray didasarkan pada hibridisasi yang terdiri dari satu set sasaran yang diketahui. | NGS didasarkan pada sintesis yang menggunakan polimerase DNA untuk menggabungkan nukleotida dan tidak bergantung kepada sasaran yang dipilih sebelumnya. |
Ringkasan - Urutan Mikro vs Penjujukan Generasi Seterusnya
Dalam konteks penyelidikan, penjujukan DNA telah menjadi pemecut penting. Ia digunakan secara meluas dalam bioteknologi, diagnosis perubatan, dan kajian forensik. Ini telah berkembang dan berkembang menjadi prosedur penjujukan yang lebih cekap dan pantas. Microarrays dan NGS adalah dua teknik penjujukan DNA maju yang ada. Kedua-duanya dikembangkan menggunakan penjujukan berdasarkan array. Teknik microarray bergantung pada hibridisasi sementara NGS didasarkan pada sintesis, yang menggunakan polimerase DNA untuk menggabungkan nukleotida. Ini adalah perbezaan utama antara Urutan Mikro dan Penjujukan Generasi Seterusnya.
Muat turun Versi PDF Microarray vs Urutan Generasi Seterusnya
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam catatan petikan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara Urutan Microarray dan Generasi Seterusnya
