Perbezaan antara Embden Meyerhof Pathway dan Entner Doudoroff Pathway adalah bahawa Embden Meyerhof Pathway adalah glikolisis klasik yang mengubah glukosa menjadi piruvat pada eukariota dan banyak prokariota. Pada masa yang sama, Entner Doudoroff Pathway adalah jalur glikolisis alternatif dalam beberapa bakteria dan mengubah glukosa menjadi piruvat untuk menghasilkan ATP.
Glikolisis adalah tahap pertama pernafasan selular, yang mengubah glukosa menjadi piruvat. Terdapat serangkaian tindak balas yang berlaku semasa glikolisis. Ia juga menghasilkan dua molekul ATP sebagai pengeluaran bersih. Jalur Embden Meyerhof adalah sinonim dari glikolisis. glikolisis berlaku pada eukariota dan banyak prokariota, dan mereka menggunakan glukosa untuk menghasilkan ATP. Tetapi pada prokariota tertentu, terutama pada bakteria tertentu, ada alternatif untuk glikolisis. Laluan ini dikenali sebagai Entner Doudoroff Pathway. Oleh itu, jalur Entner Doudoroff menggantikan glikolisis klasik dalam beberapa jenis bakteria.