Perbezaan utama antara inaktivasi X rawak dan tidak dicetak adalah bahawa inaktivasi X rawak adalah ketidakaktifan kromosom X ibu dan ibu dengan kebarangkalian yang sama semasa masa gastrulasi di epiblast, sementara inaktivasi X yang dicetak adalah inaktivasi X bukan rawak dari X yang berasal dari ayah. kromosom dalam tisu ekstrembryonik mamalia.
Inaktivasi X adalah proses yang dilihat pada mamalia betina. Secara amnya, betina mempunyai dua kromosom X. Dan, pada mamalia betina, satu kromosom X menjadi tidak aktif. Dengan kata lain, satu kromosom X menjadi struktur tidak transkripsi. Setelah ini berlaku, kromosom X ini tetap tidak aktif sepanjang hayat sel dan keturunannya dalam organisma. Selanjutnya, kromosom X yang tidak aktif mengembun menjadi struktur padat yang disebut badan Barr, dan ia dikekalkan dengan stabil dalam keadaan senyap. Juga, proses inaktivasi X bergantung pada kawalan dua RNA pelengkap bukan pengekodan. Walau bagaimanapun, ketidakaktifan X tidak berlaku pada lelaki, yang hanya mempunyai satu kromosom X. Lebih-lebih lagi, ketidakaktifan X boleh berlaku secara rawak atau disebabkan oleh pencetakan.
