Perbezaan Utama - Proteomik vs Transkriptomik
Teknologi omic adalah arus terkini, di mana biomolekul organisma yang berbeza dilihat sebagai koleksi keseluruhan berkaitan dengan sifat dan fungsinya. Teknologi omic mempunyai pelbagai aplikasi. Omik yang berbeza dari sampel biologi merangkumi genomik, proteomik, transkriptik dan metabolomik. Proteomik melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. Ia didefinisikan sebagai kumpulan semua protein yang dinyatakan dalam organisma, sifat struktur dan fungsinya. Oleh itu, kumpulan protein yang lengkap membentuk proteome. Transcriptomics adalah kajian lengkap terhadap semua molekul RNA (mRNA) messenger yang terdapat dalam organisma hidup. Oleh itu, transkripomik berkaitan dengan gen yang secara aktif dinyatakan dalam organisma hidup. Jumlah keseluruhan mRNA dalam organisma hidup disebut sebagai transkripome. Perbezaan utama antara Proteomics dan Transcriptomics adalah berdasarkan jenis biomolekul. Dalam proteomik, jumlah protein yang dinyatakan dalam organisma hidup dikaji sedangkan, dalam transkriptomik, jumlah mRNA organisma hidup dikaji.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Proteomik
3. Apa itu Transkriptomik
4. Persamaan Antara Proteomik dan Transkripomik
5. Perbandingan Berdampingan - Proteomik vs Transkriptomik dalam Borang Jadual
6. Ringkasan
Apa itu Proteomik?
Istilah proteomik dicipta pada tahun 1995 dan pada awalnya ditakrifkan sebagai jumlah pelengkap protein dalam sel, tisu atau organisma. Dengan kemajuan dalam kajian proteomik, kemudian diubah untuk dianggap sebagai istilah payung di mana banyak bidang kajian dimasukkan. Pada masa ini, di bawah topik proteomik, struktur, orientasi, fungsi, interaksinya, pengubahsuaiannya, aplikasinya dan kepentingan protein dikaji. Oleh itu, banyak kajian dilakukan dalam bidang proteomik pada masa ini.
Kajian proteomik pertama dilakukan untuk mengenal pasti kandungan protein dalam Escherichia coli. Pemetaan total kandungan protein dilakukan dengan menggunakan gel dua dimensi (2D). Selepas kejayaan ini, para saintis beralih ke ciri keseluruhan kandungan protein pada haiwan seperti babi guinea dan tikus. Pada masa ini, pemetaan protein manusia dilakukan dengan menggunakan elektroforesis gel 2D.
Aplikasi Proteomik
Terdapat banyak kelebihan mempelajari proteomik, kerana protein adalah molekul yang mengatur sebahagian besar aktiviti kerana sifat pemangkin protein. Oleh itu, kajian keseluruhan protein dapat memberikan maklumat mengenai status kesihatan organisma. Beberapa aplikasi adalah;
- Anotasi genom: Dengan mengkaji kandungan protein organisma, genom tepat yang bertanggungjawab untuk sebatian protein aktif dapat ditentukan. Dalam senario ini hasil dari semua genomik, Transkriptomik dan proteomik adalah penting.
- Identifikasi penyakit / Diagnostik: Proteomik digunakan dalam mengenal pasti keadaan penyakit, dengan membandingkan yang sihat dan yang berpenyakit
- Untuk menjalankan ekspresi protein yang dikaji semasa eksperimen.
- Kajian modifikasi dan interaksi protein: Untuk menggunakan protein dalam keadaan in vitro atau dan dalam keadaan in vivo, untuk menentukan keadaan penyimpanan protein yang diekstrak ini dan untuk mengkaji tingkah laku protein dalam kaedah in vitro, in vivo dan in - silico.
Gambar 01: Proteomik
Terdapat teknik yang berbeza yang terlibat dalam proteomik
- Pengekstrakan jumlah protein dan pemisahan protein menggunakan elektroforesis gel 2D. Protein juga boleh dipisahkan menggunakan Kromatografi Cecair Berprestasi Tinggi (HPLC).
- Urutan protein yang diekstrak menggunakan kaedah seperti kaedah penjujukan Edmund atau spektrometri Massa.
- Setelah urutan dikenal pasti, sifat struktur dan fungsi kandungan protein dianalisis menggunakan perisian berasaskan komputer dan alat bioinformatik.
Apa itu Transkripomik?
Istilah transkripome dicipta baru-baru ini. The Transcriptomics adalah kajian mengenai jumlah kandungan mRNA organisma. Jumlah mRNA adalah DNA yang dinyatakan dalam organisma hidup atau sel. Koleksi lengkap mRNA disebut sebagai transkripome.
Langkah-langkah untuk menganalisis transkripome merangkumi,
- Pengekstrakan RNA, pemisahan mRNA menggunakan kromatografi gel gel dengan manik poli DT.
- Penjujukan mRNA dilakukan.
Teknologi microarray adalah salah satu cara yang biasa untuk mengenal pasti transkripome organisma. Teknik microarray melibatkan plat probe dengan helai pelengkap transkripome. Setelah hibridisasi, mRNA yang terdapat dalam organisma atau sel dapat dicirikan.
Gambar 02: Teknik Transkripomik
Transkriptomik kini banyak digunakan dalam bidang perubatan. Diagnostik penyakit dan profil penyakit adalah bidang utama di mana Transcriptomics digunakan. Dengan menganalisis transkripom organisma, mRNA asing dapat dikenal pasti, dan jika ada jangkitan, ia dapat dikenal pasti. RNA bukan pengekodan dapat dipisahkan dengan menggunakan teknologi transkripomik. Dan juga ekspresi gen di bawah tekanan persekitaran yang berbeza dapat dipantau.
Apakah Persamaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?
- Kedua-duanya menjadi sebahagian daripada konsep teknologi omic.
- Kedua-duanya digunakan dalam diagnostik penyakit dan pencirian penyakit organisma.
- Kedua-dua bidang kajian melibatkan pengambilan biomolekul, pemisahan biomolekul dan langkah penjujukan.
Apakah Perbezaan Antara Proteomik dan Transkriptomik?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Protemik vs Transkriptomik |
|
| Proteomik melibatkan kajian lengkap semua protein dalam organisma hidup. | Transcriptomics adalah kajian lengkap terhadap semua molekul RNA (mRNA) messenger yang terdapat dalam organisma hidup. |
| Jenis Molekul Bio yang Dipelajari | |
| Protein dikaji dalam proteomik. | mRNA dikaji dalam transkriptomik. |
| Faktor yang dikaji | |
| Struktur, fungsi, interaksi, modifikasi dan aplikasi protein dipelajari dalam proteomik. | Struktur urutan, interaksi dengan persekitaran dan aplikasi mRNA dikaji dalam transkripomik. |
Ringkasan - Proteomics vs Transcriptomics
Omics memainkan peranan penting dalam bidang sains kehidupan. Proteomics merujuk kepada kajian proteome yang membentuk kumpulan protein lengkap dalam sel atau organisma. Transcriptomics merujuk kepada kajian transkripom yang merupakan set lengkap DNA yang dinyatakan dalam bentuk mRNA. Dua bidang kajian, proteomik dan transkriptomik, diturunkan setelah pengenalan genomik dan kini digunakan secara meluas dalam diagnostik perubatan dan pencirian dan pemeriksaan organisma. Ini adalah perbezaan antara proteomik dan transkriptomik.
Muat turun PDF Proteomics vs Transcriptomics
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam catatan petikan. Sila muat turun versi PDF di sini: Perbezaan Antara Proteomik dan Transkriptik
