Perbezaan Utama - Transposase Bakteria vs Integrasi Retroviral
Bahan genetik yang dapat diangkut telah berkembang dengan dua strategi utama untuk berpindah dari satu wilayah ke wilayah seterusnya di dalam dan antara genom. Salah satu kaedah adalah dengan mengganti molekul RNA sebelum pembentukan molekul DNA sementara jalur lain melibatkan perantaraan DNA. Transposase dan integrase virus adalah contoh bahan genetik transposable. Transposase bakteria mengikat pada akhir transposon dan memudahkan pemangkin pergerakan transposon ke bahagian lain dari genom melalui pelbagai mekanisme. Retroviral integrase adalah enzim yang membantu penyatuan bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel inang yang dijangkiti. Ini adalah perbezaan utama antara transposase bakteria dan integrase retroviral.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu Transposida Bakteria
3. Apakah Integrasi Retroviral
4. Persamaan Antara Transposase Bakteria dan Integrasi Retroviral
5. Perbandingan Berdampingan - Transposisi Bakteria vs Integrasi Retroviral dalam Bentuk Jadual
6. Ringkasan
Apakah Transposisi Bakteria?
Transposase dapat didefinisikan sebagai enzim yang terikat pada akhir transposon yang memudahkan pemangkin pergerakan transposon ke bahagian lain dari genom melalui pelbagai mekanisme. Mekanisme tersebut merangkumi 'mekanisme potong dan tampal' dan 'mekanisme transposisi replikasi'. Transposase pertama kali diperkenalkan melalui pengklonan enzim yang diperlukan untuk pemindahan transposon Tn3. Dua strategi penting telah digunakan oleh unsur genetik transposable untuk perpindahan antara genom atau dari satu laman web ke lokasi yang lain. Pengangkutan melalui perantara RNA sebelum sintesis salinan DNA adalah satu strategi sementara yang lain hanya terikat pada perantaraan DNA sahaja. Reaksi penggabungan yang terlibat dalam penyatuan kedua-dua unsur berlaku kerana enzim khusus unsur. Oleh itu,dalam contoh unsur DNA, enzim ini dikenal sebagai transposase sementara dalam contoh unsur RNA, mereka dikenali sebagai integrase.
Ketika membandingkan perbezaan antara kedua strategi transposisi, proses penyisipan nampaknya sama secara kimia. Tetapi, bukti terkini menunjukkan bahawa persamaan tertentu dalam mekanisme integrasi dilihat di kawasan urutan asid amino yang membentuk laman web aktif; motif DDE. Lima keluarga transposase diklasifikasikan pada masa ini tetapi, jumlah keluarga belum meningkat dengan watak transposase baru. Keluarga tersebut merangkumi transposase DDE, transposase Tyrosine (Y), transposase Serine (S), transposase bulatan bergulir, transkripase terbalik / endonuklease (RT / En) dan lain-lain. Keluarga ini menggunakan mekanisme pemangkin unik untuk pemecahan dan penyatuan semula DNA. Transposase DDE melibatkan dalam mekanisme potong dan tampal transposon asal dan membawa tiga set asid amino terpelihara iaitu;aspartat (D), aspartat (D) dan glutamat (E). Transposase tirosin juga terlibat dalam mekanisme pemotongan dan penampalan dengan penggunaan residu tirosin, yang spesifik di lokasi.
Gambar 01: Transposase Bakteria
Transposase serin melibatkan perantara DNA bulat dan menjalankan mekanisme potong dan tampal seperti keluarga di atas. Transposase bulatan bergolek melibatkan mekanisme penyalinan di mana sehelai helai disalin terus ke laman sasaran melalui replikasi DNA. Ini memastikan bahawa helai templat dan helai yang disalin mempunyai helai yang baru disintesis. Transposase transkripase terbalik / endonuklease mempunyai pelbagai mekanisme untuk transposisi.
Apa itu Retroviral Integrases?
Dalam konteks Retroviral Integrase, ia dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu penyatuan bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. Integrasi retroviral ini sering dikelirukan dengan integrase fag. Contoh untuk integrase phage adalah λ phage integrase. Tetapi ini adalah enzim yang sama sekali berbeza dan tidak boleh dikelirukan. Berkenaan dengan pembentukan kompleks pra-integrasi retroviral, integrase retroviral memainkan peranan utama. Protein integrase retroviral biasanya terdiri daripada tiga (03) domain kanonik. Domain ini dihubungkan oleh penghubung fleksibel.
Ketiga domain tersebut merangkumi domain pengikat zink terminal N di mana tiga bundar heliks dihubungkan dan distabilkan melalui koordinasi dengan penglibatan Zn 2+kation, domain teras pemangkin lipatan RNase H dan domain pengikatan DNA terminal C, yang merupakan lipatan SH3. Dengan penyiasatan dan melalui maklumat biokimia dan struktur, ini menunjukkan bahawa retroviral integrase mempunyai kemampuan untuk berfungsi sebagai dimer dimmer (tetramer). Dalam konteks pengikatan DNA multimerisasi dan virus, ketiga-tiga domain protein integrase retroviral. Fungsi utama integrase retroviral adalah memasukkan bahan genetiknya untuk menjadi tuan rumah DNA. Langkah ini adalah langkah paling penting dalam mereplikasi virus HIV. Setelah berjaya disatukan, ia akan berada di dalam DNA kromosom sel sepanjang jangka hayatnya.
Gambar 02: Integrasi Retroviral
Oleh itu, setelah disatukan tidak ada pulangan untuk sel. Integrasi retroviral ini melibatkan pemangkin dua reaksi utama termasuk pemprosesan akhir 3 'dan ligasi kovalen. Semasa pemprosesan akhir 3 ', 2-3 nukleotida dari kedua-dua hujung DNA virus 3' dikeluarkan dengan tujuan untuk mendedahkan dinukleotida CA dari ujung 3 'DNA virus, dan semasa ligasi kovalen, ujung 3' yang diproses DNA virus dihubungkan secara kovalen ke dalam DNA kromosom host.
Apakah Kesamaan Antara Transposase Bakteria dan Integrasi Retroviral?
Kedua-dua Transposase Bakteria dan Retroviral Integrase mempunyai urutan asid amino yang serupa
Apakah Perbezaan Antara Transposases Bakteria dan Integrasi Retroviral?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
Transposases bakteria vs Integrasi Retroviral |
|
| Transposase bakteria adalah enzim yang terikat pada akhir transposon sambil memudahkan pemangkin pergerakan transposon ke bahagian lain dari genom melalui pelbagai mekanisme. | Retroviral Integrases dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu penyatuan bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. |
| Kawasan Mengikat | |
| Kawasan pengikatan khusus yang tinggi diperlukan untuk Transposase Bakteria. | Urutan nukleotida kurang atau tidak diperlukan untuk mengikat. |
Ringkasan - Transposase Bakteria vs Integrasi Retroviral
Transposase bakteria dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu penyatuan bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. Dua strategi penting telah digunakan oleh unsur genetik transposable untuk perpindahan antara genom atau dari satu laman web ke lokasi yang lain. Lima keluarga transposase diklasifikasikan pada masa ini tetapi, jumlah keluarga belum meningkat dengan watak transposase baru. Retroviral Integrase, ia dianggap sebagai enzim retroviral yang membantu penyatuan bahan genetik retrovirus seperti HIV ke dalam bahan genetik (DNA) sel yang dijangkiti. Protein integrase retroviral biasanya terdiri daripada tiga (03) domain kanonik. Fungsi utama integrase retroviral adalah memasukkan bahan genetiknya untuk menjadi tuan rumah DNA. Langkah ini adalah langkah paling penting dalam mereplikasi virus HIV. Oleh itu, setelah disatukan tidak ada pulangan untuk sel. Ini adalah perbezaan antara transposase bakteria dan Retroviral Integrase.
Muat turun PDF Transposases Bakteria vs Integrasi Retroviral
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam catatan petikan. Sila muat turun versi PDF di sini: Perbezaan Antara Transposisi Bakteria dan Integrasi Retroviral
