Perbezaan utama antara mesenchyme dan ectomesenchyme bergantung pada jenis sel yang dikandungnya. Mesenchyme mengandungi sel-sel longgar yang mudah berpindah untuk membentuk tisu tanah kolagen, dan tisu tulang dan tulang rawan sementara ectomesenchyme mengandungi sel-sel puncak saraf dan membentuk tisu leher dan tengkorak.
Kedua-dua mesenchyme dan ectomesenchyme hadir dalam tahap embrio. Perkembangan mesenchyme dan ectomesenchyme penting untuk mengkaji perkembangan pelbagai tisu yang timbul dari sel-sel ini.