Perbezaan utama antara mutasi titik dan mutasi kromosom adalah bahawa mutasi titik adalah mutasi skala kecil di mana sepasang asas tunggal urutan DNA atau RNA berubah sementara mutasi kromosom adalah mutasi skala besar di mana struktur kromosom berubah.
Mutasi adalah perubahan atau perubahan dalam urutan nukleotida DNA atau RNA. Mutasi adalah penyebab utama kebolehubahan genetik di antara organisma. Mutasi berlaku pada sel somatik dan juga sel sel kuman. Sebilangan mutasi diwarisi oleh generasi seterusnya sementara yang lain tidak boleh diwarisi. Mutasi somatik mempengaruhi organisma sekarang sementara mutasi kuman menyebarkan ke generasi seterusnya. Mutasi titik dan mutasi kromosom adalah dua jenis mutasi yang biasa. Mutasi titik adalah jenis mutasi termudah yang timbul kerana perubahan pasangan asas tunggal. Sebaliknya, mutasi kromosom adalah perubahan skala yang agak besar di mana struktur atau bilangan kromosom berubah dalam organisma.