Perbezaan utama antara mamalia dan reptilia adalah bahawa mamalia adalah vertebrata berdarah hangat yang dapat mengatur suhu badan dalaman sementara reptilia adalah vertebrata berdarah dingin yang tidak dapat mempertahankan suhu badan yang tetap.
Vertebrata adalah haiwan yang mempunyai tulang belakang atau lajur vertebra. Mereka boleh berdarah panas atau berdarah sejuk. Haiwan berdarah panas dapat mengatur suhu dalaman badan sementara haiwan berdarah dingin tidak dapat mengatur suhu badan yang tetap. Oleh itu, suhu badan mereka berubah mengikut persekitaran luar.
Terdapat lima kumpulan vertebrata utama iaitu ikan, amfibia, reptilia, burung dan mamalia. Antaranya, burung dan mamalia berdarah hangat sementara ikan, amfibia dan reptilia berdarah sejuk. Semasa mempertimbangkan mamalia dan reptilia, keduanya adalah vertebrata yang bernafas oksigen yang memerlukan makanan untuk hidup. Juga, kedua-duanya mempunyai komponen organ yang sama seperti otak, jantung, perut, paru-paru, dan lain-lain. Selanjutnya, mamalia dan reptilia adalah tetrapod, yang bermaksud bahawa kedua-duanya mempunyai empat anggota badan. Walaupun ini adalah beberapa persamaan antara keduanya, ada juga banyak perbezaan antara mamalia dan reptilia.
