Perbezaan utama antara protoxylem dan metaxylem adalah bahawa protoxylem adalah xilem primer terbentuk pertama yang mempunyai sel yang lebih kecil, terutama saluran sempit dan trakeid sementara metaxylem adalah xilem primer terbentuk kemudian yang mempunyai sel yang lebih besar, terutama kapal yang lebih luas, dan trakeid.
Xylem adalah salah satu daripada dua jenis tisu vaskular pada tumbuhan. Xylem melakukan pergerakan air dan mineral ke atas dari akar ke bahagian lain tanaman. Ini adalah struktur seperti tiub yang mengandungi pelbagai jenis sel khusus termasuk unsur kapal, trakeid, parenkim, dan serat. Terdapat dua jenis xilem sebagai xilem primer dan xilem sekunder. Xilem primer berkembang semasa pertumbuhan primer. Tambahan pula, xilem primer mempunyai dua bahagian: protoxylem dan metaxylem. Kedua-dua protoxylem dan metaxylem berasal dari pro-cambium semasa pertumbuhan primer. Protoxylem berasal pertama, dan metaxylem berasal selepas protoxylem.
