Perbezaan utama antara pewarnaan progresif dan regresif adalah bahawa dalam pewarnaan progresif, tisu ditinggalkan dalam larutan pewarnaan cukup lama untuk mencapai titik akhir yang diinginkan sementara dalam pewarnaan regresif, tisu sengaja ditinggalkan untuk pewarnaan berlebihan sehingga pewarna memenuhi semua elemen tisu dan kemudian dicemarkan.
Pewarnaan adalah teknik yang menyoroti dan membezakan komponen tisu dan membuatnya dapat diperhatikan di bawah mikroskop. Pewarnaan H dan E adalah prosedur pewarnaan tisu umum yang paling sering digunakan dalam histologi. Ia menggunakan haematoxylin dan eosin (counterstain). Pewarnaan nuklear menggunakan haematoxylin dapat dilakukan dengan teknik pewarnaan progresif atau regresif. Beberapa formulasi haematoxylin digunakan dalam pewarnaan progresif. Hematoksilin Mayer adalah salah satu contohnya. Noda progresif mempunyai kepekatan haematoxylin yang rendah. Oleh itu, mereka secara perlahan dan selektif mengotorkan kromatin. Beberapa formulasi lain digunakan dalam pewarnaan regresif. Harris haematoxylin digunakan dalam pewarnaan regresif. Noda regresif mempunyai kepekatan haematoxylin yang tinggi; oleh itu, noda cepat menyebar ke seluruh sel.
