Perbezaan utama antara pergerakan autonomi dan paratonik adalah bahawa pergerakan autonomi adalah tindak balas terhadap rangsangan yang dihasilkan di dalam tumbuhan disebabkan oleh gen sedangkan pergerakan paratonik adalah tindak balas tumbuhan terhadap rangsangan luar tanpa penglibatan gen.
Tumbuhan bertindak balas terhadap rangsangan luaran; mereka juga bertindak balas terhadap rangsangan yang dihasilkan di dalam tanaman. Berdasarkan itu, terdapat dua jenis pergerakan sebagai pergerakan autonomi dan pergerakan paratonik. Pergerakan autonomi adalah tindak balas yang ditunjukkan kepada beberapa penyebab dalaman, terutamanya kerana penglibatan gen. Sebaliknya, pergerakan paratonik adalah tindak balas yang ditunjukkan terhadap rangsangan luaran seperti panas, tekanan, air, cahaya matahari, dan lain-lain. Oleh kerana penglibatan gen, pergerakan autonomi terdapat pada tumbuhan sejak lahir, tidak seperti pergerakan paratonik.