Perbezaan utama antara dikaryon dan heterokaryon adalah bahawa dikaryon merujuk kepada sel kulat yang mengandungi tepat dua nukleus yang berbeza secara genetik dalam sitoplasma yang sama, sementara heterokaryon merujuk kepada sel yang mengandungi dua atau lebih inti yang berbeza secara genetik di dalam sitoplasma biasa.
Plasmogamy dan karyogamy adalah dua proses pembiakan seksual. Secara amnya, plasmogami berlaku sebelum karyogami. Semasa plasmogami, membran sel dari dua jenis sel kawin tersebut menyatu antara satu sama lain menjadi sel biasa. Semasa karyogami, dua inti yang berbeza secara genetik menyatu antara satu sama lain. Kadang-kadang karyogami tidak langsung mengikuti plasmogami. Pada masa itu, dua atau lebih inti wujud dalam sitoplasma yang sama. Dikaryon dan heterokaryon adalah dua keadaan tersebut.