Perbezaan utama antara amonia dan amonium adalah bahawa amonia adalah molekul polar yang tidak terisi yang ada sebagai gas pada suhu bilik, sedangkan ion amonium dicas dan wujud sebagai ion bebas dalam larutan atau sebagai sebatian garam kristal.
Terdapat beberapa gambar dan bahkan bau tertentu yang langsung dikaitkan oleh fikiran kita dengan amonia atau amonium; ini termasuk baja, sisa nitrogen, sabun dan juga bahan letupan. Lebih-lebih lagi, kebanyakan orang menganggap bahawa tidak ada perbezaan antara amonia dan amonium. Kesamaan yang tinggi antara kedua-duanya, dan penggunaan kata amonia lebih kerap sebagai istilah umum untuk sebatian amonia tulen dan amonium inilah yang menimbulkan kekeliruan ini.
