Perbezaan utama antara homozigot dan heterozigot adalah bahawa homozigot bermaksud kedua alel serupa untuk sifat sementara heterozigot bermaksud kedua alel berbeza untuk sifat.
Gen yang diwarisi dari kromosom ibu bapa mengawal semua watak atau sifat haiwan, tumbuh-tumbuhan, dan semua makhluk hidup yang lain. Ini adalah sebab utama untuk menunjukkan ciri-ciri ibu bapa dalam keturunan. Sebilangan besar organisma eukariotik mempunyai dua set gen yang dikenali sebagai gen ibu dan gen bapa. Oleh itu, keadaan genetik dikenali sebagai diploid (dua set kromosom). Maksudnya; semua sifat mempunyai komponen genetik dari ibu dan bapa. Walau bagaimanapun, gen ini boleh menjadi dominan atau resesif antara satu sama lain dan di situlah ciri-ciri homozigot dan heterozigot menjadi penting. Homozigot adalah keadaan yang mempunyai dua alel dominan (AA) atau dua alel resesif (aa) sementara heterozigot adalah keadaan yang mempunyai satu alel dominan dan satu alel resesif (Aa).
