Perbezaan utama antara porin dan aquaporin adalah bahawa porin adalah pori-pori berisi air dan saluran yang terdapat di membran bakteria dan eukariota. Sementara itu, aquaporin adalah protein membran yang membentuk saluran selektif air dalam sel hidup.
Molekul yang berbeza masuk dan keluar sel melintasi membran plasma pada organisma hidup. Oleh itu, terdapat protein membran yang berlainan dalam membran plasma untuk mengekalkan dan mengatur molekul yang masuk dan keluar dari sel. Porin dan aquaporin adalah dua jenis protein membran seperti itu. Dari jumlah tersebut, porin adalah liang berisi air yang memudahkan pengangkutan molekul hidrofilik melintasi membran. Sementara itu, akuaporin adalah saluran selektif air yang secara khusus membenarkan air melepasi membran secara bebas.
