Perbezaan utama antara zooidogami dan siphonogami adalah bahawa zooidogami adalah keadaan di mana gamet lelaki berenang di dalam air untuk mencapai gamet betina mereka sementara siphonogami adalah keadaan di mana tiub debunga dikembangkan untuk membawa gamet lelaki ke gamet wanita.
Pembiakan seksual berlaku dengan cara yang berbeza antara kumpulan tumbuhan yang berbeza. Untuk menyelesaikan persenyawaan, gamet lelaki harus mencapai gamet betina. Zooidogamy dan siphonogamy adalah dua cara yang menjelaskan bagaimana gamet lelaki bergerak ke arah gamet betina. Dalam zooidogami, gamet lelaki berenang ke arah gamet betina sementara di siphonogami, gamet lelaki bergerak melalui tiub debunga ke arah gamet betina. Contohnya, alga, bryophytes, pteridophytes, dan beberapa gymnosperma menunjukkan zooidogami sementara tanaman biji menunjukkan siphonogami.