Perbezaan utama antara contig dan scaffold adalah bahawa contig tidak mempunyai jurang sementara perancah terdiri dari contig dan celah.
Penjujukan genom organisma multisel sangat sukar dibandingkan dengan penjujukan organisma uniselular. Penjejakan senapang keseluruhan genom adalah teknik penjujukan genom yang mudah dan pantas untuk genom multiselular. Ini adalah kaedah yang menguraikan banyak serpihan DNA yang bertindih secara selari. Dalam kaedah ini, serpihan kecil disatukan menjadi serpihan yang lebih besar dan kemudian menjadi contengan yang lebih besar menggunakan komputer. Kemudian contig dipasang menjadi perancah dan akhirnya menjadi kromosom. Oleh itu, contig adalah urutan nukleotida yang berterusan manakala perancah adalah bahagian genom yang terdiri daripada contig dan celah. Kedua-dua contig dan scaffold adalah urutan genomik yang dibina semula.
