Perbezaan utama antara klorin bebas dan klorin total adalah bahawa klorin bebas adalah jumlah klorin yang dapat mematikan mikroorganisma patogen yang terdapat di dalam air sedangkan klorin total adalah jumlah gabungan klorin dan klorin bebas. Nilai klorin bebas selalu lebih rendah daripada nilai klorin total.
Klorin gabungan adalah jumlah klorin yang bertindak balas dengan sebatian yang mengandungi nitrogen yang terdapat di dalam air. Oleh itu, klorin ini tidak tersedia untuk proses pembasmian kuman air. Ini bermaksud istilah jumlah klorin memberikan jumlah klorin yang ada dan tidak tersedia untuk pengaktifan mikroorganisma patogen (penyebab penyakit) di dalam air.