Perbezaan utama antara Protostomes dan Deuterostomes adalah bahawa di protostomes blastopore menjadi mulut sementara di deuterostomes menjadi anus. Perbezaan utama lain adalah bahawa embrio protostom mengalami pembelahan spiral sementara embrio deuterostomes mengalami pembelahan radial.
Dalam memahami kedua istilah ini, penting untuk memperhatikan bagaimana perkembangan organisma embrio berlaku. Adalah sangat penting untuk mempertimbangkan haiwan dengan koelom, yang merupakan rongga berisi cecair yang terletak di antara endoderm (usus) dan mesoderm (kebanyakan lapisan otot); dengan kata lain, coelom adalah peritoneum pada mamalia. Protostomes dan deuterostomes adalah dua jenis haiwan coelomate utama, dan terdapat banyak perbezaan di antara mereka. Mereka terutamanya berbeza dalam cara mulut dan dubur mereka terbentuk semasa perkembangan embrio.
