Perbezaan utama antara neurotransmitter dan hormon adalah bahawa neurotransmitter adalah utusan kimia yang digunakan oleh sistem saraf untuk menghantar impuls saraf melintasi sinapsis sementara hormon adalah utusan kimia yang digunakan oleh sistem endokrin untuk merangsang atau berkomunikasi dengan sel sasaran tertentu.
Sistem saraf dan sistem endokrin adalah sistem organ yang sangat penting dalam badan kita yang mengatur pelbagai aktiviti. Kedua-dua sistem bergantung pada pembebasan bahan kimia khas sama ada sebagai neurotransmitter atau sebagai hormon. Neurotransmitter dan hormon ini bertindak sebagai utusan kimia dan memudahkan transmisi impuls saraf dan pengaturan aktiviti fisiologi dalam badan kita.