Perbezaan utama antara stomata dan sel pengawal adalah bahawa stomata adalah liang yang terletak di epidermis daun, batang, dan lain-lain, sementara sel pelindung adalah sel yang mengelilingi dan mengatur pembukaan dan penutupan stomata.
Pernafasan dan fotosintesis adalah dua proses penting dalam tumbuh-tumbuhan. Dalam kedua proses tersebut, pertukaran gas adalah penting. Stomata dan sel pengawal memudahkan tugas pertukaran gas di kilang. Di sini, sel-sel penjaga adalah sel-sel parenkim, dan mereka adalah sel-sel yang mengelilingi stomata. Sel pengawal mengawal transpirasi, yang merupakan proses penting tanaman yang menjaga kesihatan tanaman. Selanjutnya, sel pengawal mengandungi klorofil. Oleh itu, mereka juga mampu melakukan fotosintesis.