Perbezaan utama antara penjajahan dan jangkitan adalah bahawa penjajahan adalah proses pembentukan mikroba dalam tisu badan sementara jangkitan adalah proses menyerang tisu badan oleh mikroba untuk menyebabkan gejala penyakit.
Patogenitas mikrob adalah proses biokimia dan struktur lengkap yang ditentukan oleh mekanisme lengkap di mana mikroorganisma menyebabkan penyakit. Sebagai contoh, patogenik bakteria boleh dikaitkan dengan komponen sel bakteria yang berlainan seperti kapsul, fimbriae, lipopolysaccharides (LPS) dan komponen dinding sel lain. Kita juga boleh mengaitkannya dengan rembesan aktif zat yang merosakkan tisu inang atau melindungi bakteria dari pertahanan tuan rumah. Kolonisasi dan jangkitan adalah dua istilah dalam patogenik mikrob. Tahap pertama patogenik mikrob adalah penjajahan. Ia dikenali sebagai pembentukan patogen yang betul dalam tisu inang. Sebaliknya, jangkitan adalah pencerobohan tisu badan oleh patogen untuk menyebabkan penyakit ini.
