Perbezaan utama antara evolusi mikro dan evolusi makro adalah bahawa evolusi mikro merangkumi perubahan evolusi skala kecil terutama dalam populasi spesies tunggal sedangkan evolusi makro merangkumi perubahan evolusi skala besar yang berada di luar batas populasi spesies tunggal dalam jangka masa yang lebih lama.
Evolusi adalah proses semula jadi yang berlaku sendiri dalam jangka masa yang panjang. Evolusionis dan pencipta mempunyai pandangan yang berbeza mengenai bagaimana spesies organisma berlainan wujud dan bagaimana mereka berkembang dari spesies primitif. Oleh yang demikian, evolusionis adalah mereka yang mempercayai kelangsungan teori pemilihan dan penolakan Darwin yang paling tepat dan sementara pencipta adalah orang yang menolak teori ini walaupun menerima perubahan pada spesies haiwan tertentu yang berlaku dalam jangka hayat. Lebih-lebih lagi, penciptaan menggambarkan perubahan-perubahan ini sebagai evolusi mikro sedangkan dengan senangnya tidak setuju dengan evolusi makro, itulah yang dikemukakan oleh teori evolusi. Bagaimanapun, evolusi mikro dan evolusi makro melibatkan prinsip yang sama dan berlaku kerana mekanisme yang sama; mutasi dan pemilihan semula jadi. Tetapi,skala perubahan evolusi mereka berbeza.
