Perbezaan utama antara darah induk dan sel stem sumsum tulang adalah bahawa sel stem darah tali pusat adalah sel hematopoietik yang terdapat di tali pusat bayi yang baru lahir selepas kelahiran sementara sel stem sumsum tulang adalah sel stem yang terdapat di sumsum tulang tisu individu.
Transplantasi sel stem adalah prosedur terapeutik yang biasa di mana pesakit menerima dos sel pembentuk darah (stem) untuk menggantikan sel-sel yang musnah sendiri oleh penyakit atau dengan prosedur terapi lain. Kedua-dua sel stem darah tali pusat dan sel stem sumsum tulang mempunyai tujuan terapeutik (transplantasi). Oleh itu, penggunaan sel stem ini adalah menggantikan sel yang tidak sihat dengan sel yang sihat. Secara klinikal, sumber sel sihat yang paling biasa adalah sel tali pusat dan sel sumsum tulang.