Perbezaan utama antara mitosis dan pembelahan binari adalah bahawa mitosis adalah sejenis pembelahan nuklear yang berlaku pada organisma eukariotik untuk menghasilkan dua sel anak yang sama dari sel induk sementara pembelahan binari adalah sejenis pembiakan aseksual / pembelahan sel yang berlaku pada prokariotik organisma untuk membiak dan menambah bilangannya.
Semua bentuk kehidupan prokariota dan eukariota perlu mempunyai beberapa kaedah untuk melipatgandakan unit inti mereka; "Sel" tanpa mengira kerumitan organisasi selular mereka. Oleh itu, proses ini sangat penting untuk pertumbuhan dan pertumbuhan semula organisma berbilang sel, serta untuk pembiakan aseksual pada beberapa organisma uniselular. Dalam hal ini, proses kedua, mitosis dan pembelahan binari, nampaknya mempunyai hasil yang serupa untuk menghasilkan dua unit dari satu. Walau bagaimanapun, analisis mendalam dan mendalam terhadap kedua-dua proses tersebut menunjukkan perbezaan yang ketara antara mitosis dan pembelahan binari.