Perbezaan utama antara warisan sitoplasma dan pewarisan nuklear adalah bahawa warisan sitoplasma berlaku dari gen yang terdapat dalam organel sitoplasma sementara pewarisan nuklear berlaku dari gen yang terdapat pada kromosom.
Persenyawaan adalah gabungan gamet lelaki dan wanita bersama-sama. Oleh itu, semasa persenyawaan, sperma haploid dan sel telur haploid bersatu dan membentuk zigot diploid. Sel sperma memindahkan nukleusnya ke sel telur untuk penyatuan. Zigot yang dihasilkan mempunyai sitoplasma sel telur. Dengan kata mudah, sitoplasma sel telur menjadi sitoplasma zigot. Lebih-lebih lagi, keturunan menerima gen dari kedua inti dan gen organel sitoplasma ibu. Gen nukleus dan gen organel sitoplasma diwarisi oleh keturunan. Oleh itu, terdapat dua jenis pewarisan yang berlaku semasa persenyawaan seksual. Mereka adalah warisan sitoplasma dan pewarisan nuklear.