Perbezaan utama antara isyarat intraselular dan antara sel adalah bahawa isyarat intraselular adalah komunikasi dalam sel sementara isyarat antara sel adalah komunikasi antara sel.
Sel melepaskan molekul isyarat untuk mensasarkan sel dan saling berkomunikasi melalui molekul isyarat dalam organisma multisel. Sel sasaran mempunyai reseptor di permukaan selnya dan di sitoplasma untuk menerima isyarat dan bertindak sewajarnya. Juga, di dalam sel, komunikasi berlaku antara organel dan inti untuk menjalankan fungsi sel. Oleh itu, terdapat dua jenis komunikasi sel sebagai isyarat atau komunikasi intraselular dan komunikasi atau isyarat antara sel.