Perbezaan Utama - CRISPR vs RNAi
Penyuntingan genom dan pengubahsuaian gen adalah bidang minat yang akan datang dalam genetik dan biologi molekul. Pengubahsuaian gen berlaku secara meluas untuk kajian terapi gen dan juga digunakan untuk mengenal pasti sifat gen, fungsi gen dan bagaimana mutasi pada gen dapat mempengaruhi fungsinya. Penting untuk mengembangkan kaedah yang cekap dan boleh dipercayai untuk membuat perubahan tepat pada genom sel hidup. Teknik seperti CRISPR dan RNAi digunakan untuk mengubahsuai gen dengan ketepatan tinggi. CRISPR atau Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats adalah mekanisme pertahanan imun prokariotik yang berlaku secara semula jadi yang baru-baru ini digunakan untuk penyuntingan dan pengubahsuaian gen eukariotik. Gangguan RNAi atau RNA adalah kaedah khusus urutan untuk membungkam gen dengan memperkenalkan RNA untai kecil yang bermediasi dengan asid nukleik dan mengatur ekspresi gen. Ini adalah perbezaan utama antara CRISPR dan RNAi.
KANDUNGAN
1. Gambaran Keseluruhan dan Perbezaan Utama
2. Apa itu CRISPR
3. Apa itu RNAi
4. Persamaan Antara CRISPR dan RNAi
5. Perbandingan Berdampingan - CRISPR vs RNAi dalam Borang Jadual
6. Ringkasan
Apa itu CRISPR?
Sistem CRISPR adalah mekanisme semula jadi yang terdapat pada beberapa bakteria termasuk E. coli dan archea. Ini adalah perlindungan imun adaptif terhadap pencerobohan berdasarkan DNA asing Ini adalah mekanisme urutan khusus. Sistem CRISPR mengandungi beberapa elemen pengulangan DNA. Unsur-unsur ini diselingi dengan urutan "spacer" pendek yang berasal dari DNA asing dan banyak gen Cas. Sebilangan gen Cas adalah nuklease. Oleh itu, sistem imun yang lengkap disebut sebagai sistem CRISPR / Cas.
Gambar 01: Sistem CRISPR / Cas
Sistem CRISPR / Cas berfungsi dalam empat langkah.
- Sistem ini secara genetik menambat menyerang segmen DNA phage dan plasmid (spacer) ke dalam lokasi CRISPR (disebut langkah pemerolehan spacer).
- Langkah pematangan crRNA - Tuan rumah mentranskripsikan dan memproses lokasi CRISPR untuk menghasilkan RNA CRISPR matang (crRNA) yang mengandungi kedua-dua elemen ulangan CRISPR dan elemen spacer bersepadu.
- Pengesanan crRNA - Ini difasilitasi oleh pasangan asas pelengkap. Ini penting apabila terdapat jangkitan dan ada agen berjangkit.
- Langkah gangguan sasaran - crRNA mengesan DNA asing, membentuk kompleks dengan DNA asing dan melindungi inang terhadap DNA asing.
Pada masa ini, sistem CRISPR / Cas digunakan untuk mengubah atau mengubah genom mamalia dengan penindasan atau pengaktifan transkripsi. Sel mamalia dapat bertindak balas terhadap kerosakan DNA yang dimediasi CRISPR / Cas9 dengan menggunakan mekanisme pembaikan. Ia boleh dilakukan dengan menggunakan kaedah penyatuan akhir yang tidak homolog (NHEJ) atau pembaikan yang diarahkan oleh homologi (HDR). Kedua-dua mekanisme pembaikan ini berlaku dengan memperkenalkan rehat untai berkembar. Ini menghasilkan penyuntingan gen mamalia. Oleh itu, sistem CRISPR / Cas sekarang digunakan dalam bidang aplikasi terapi, bioperubatan, pertanian dan penyelidikan.
Apa itu RNAi?
Gangguan RNA adalah teknik mediasi RNA untai ganda, yang digunakan untuk mengatur ekspresi gen. Sebatian utama yang terlibat adalah RNA kecil (siRNA) SiRNA adalah jenis khas RNA untai ganda dengan 3 'overhang dari dua nukleotida, dan kumpulan 5' fosfat. Kompleks pendiam yang diinduksi RNA (RISC) terbentuk semasa gangguan RNA yang akan mengakibatkan penurunan gen yang terikat pada siRNA.
Gambar 02: RNAi
Prosedur RNAi adalah seperti berikut.
- RNA untai dua akan diproses di sitoplasma oleh endoribonuklease jenis RNase III yang dipanggil Dicer untuk menghasilkan ~ 21 siRNA nukleotida panjang
- Pemindahan siRNA Dicer terikat ke Argonaute, dengan bantuan protein pengikat RNA untai dua (dsRNABP).
- Mengikat Argonaute ke satu helai dupleks (helai panduan). Ini akan menggantikan helai yang lain. Ini menghasilkan kompleks protein - RNA keseluruhan yang disebut RISC.
- Penggabungan kompleks RISC dengan panduan RNA helai tunggal yang menuju ke Argonaute.
- Pasangan sasaran RNA homolog dengan RNA panduan.
- Pengaktifan Argonaute mengakibatkan penurunan RNA sasaran
Apakah Kesamaan Antara CRISPR dan RNAi?
Kedua-duanya digunakan sebagai alat penyelidikan mengubah suai gen
Apakah Perbezaan Antara CRISPR dan RNAi?
Artikel Diff Tengah sebelum Jadual
CRISPR vs RNAi |
|
| CRISPR adalah mekanisme pertahanan imun yang baru-baru ini digunakan untuk penyuntingan dan pengubahsuaian gen eukariotik. | RNAi adalah kaedah khusus urutan untuk membungkam gen dengan memperkenalkan untai kecil |
| Urutan Penyasaran | |
| RNA sintetik (RNA panduan) adalah urutan penyasaran CRISPR. | siRNA adalah urutan penyasaran RNAi. |
| Kecekapan dalam Penindasan Gen | |
| Rendah CRISPR | Tinggi RNAi |
| Kesan | |
| Kejatuhan gen berlaku di CRISPR. | Penutupan / pendiam berlaku di RNAi. |
Ringkasan - CRISPR vs RNAi
CRISPR atau Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats adalah mekanisme pertahanan imun prokariotik yang berlaku secara semula jadi yang baru-baru ini digunakan untuk penyuntingan dan pengubahsuaian gen eukariotik. Gangguan RNAi atau RNA adalah kaedah khusus urutan untuk membungkam gen dengan memperkenalkan RNA untai kecil kecil yang bermediasi dengan asid nukleik dan mengatur ekspresi gen. Ini boleh diambil sebagai perbezaan asas antara CRISPR dan RNAi. Kedua-dua teknik, CRISPR / Cas dan RNAi, adalah alat yang kuat untuk manipulasi gen walaupun CRISPR / Cas tentunya lebih unggul daripada RNAi kerana dapat digunakan untuk mendorong penyisipan dan penghapusan. Kekhususannya juga tinggi dalam sistem CRISPR / Cas.
Muat turun Versi PDF CRISPR vs RNAi
Anda boleh memuat turun versi PDF artikel ini dan menggunakannya untuk tujuan luar talian seperti dalam catatan petikan. Sila muat turun versi PDF di sini Perbezaan Antara CRISPR dan RNAi
