Perbezaan utama antara hibridisasi interspesifik dan intraspesifik adalah bahawa hibridisasi interspesifik berlaku di antara dua individu berkaitan yang tergolong dalam dua spesies yang berbeza, sementara hibridisasi intraspesifik berlaku antara dua individu genetik yang berbeza dari spesies yang sama.
Hibridisasi adalah proses mengawan atau mengasingkan individu atau kumpulan yang dibezakan secara genetik. Objektif utama hibridisasi adalah untuk menggabungkan gen yang diinginkan yang terdapat dalam pelbagai organisma. Lebih-lebih lagi, hibridisasi digunakan dalam menghasilkan keturunan murni. Perkahwinan boleh dilakukan antara dua individu dari spesies yang sama atau antara dua individu dari spesies yang berbeza. Berdasarkan itu, terdapat dua jenis hibridisasi: hibridisasi intraspesifik dan hibridisasi interspesifik.