Perbezaan utama antara Pseudomonas aeruginosa dan Pseudomonas fluorescens adalah bahawa P. aeruginosa adalah patogen manusia oportunis sedangkan P. fluorescens bukan patogen manusia. Lebih jelas mengatakan, P. aeruginosa adalah patogen tumbuhan dan haiwan termasuk manusia sedangkan P. pendarfluor adalah pertumbuhan tumbuhan yang mendorong spesies bakteria. Satu lagi perbezaan penting antara Pseudomonas aeruginosa dan Pseudomonas fluorescens adalah bahawa P. aeruginosa mempunyai keupayaan untuk tumbuh walaupun pada suhu 42 ° C.
Pseudomonas adalah genus bakteria yang terdiri daripada bakteria gram negatif, berbentuk batang dan flagel polar. Mereka adalah bakteria aerobik yang tidak membentuk spora, positif katalase dan positif oksidase. Selanjutnya, genus ini mempunyai banyak spesies termasuk P. aeruginosa, P. fluorescens, P. putida, P. syringae, dll.